AI 驱动药物设计再突破——菲鹏数辉在 SAPA 大会展示复合蛋白质动态预测新成果

近日，在苏州狮山国际会议中心举办的2025医药产业大会上，菲鹏集团旗下子公司菲鹏数辉亮相并展示了其最新研发的 DeepConformer 2.0 模型，成为会场关注焦点。本次大会以“铸就创新生态圈，开启医药新纪元”为主题，由美中医药开发协会中国分会（SAPA-China）主办，苏州高新区管委会指导，共吸引全球科研机构、企业及专家学者等8000余人参与。

SAPA 作为成立32年的国际性华人生物医药组织，一直致力于推动产业合作与技术交流。SAPA-China 更通过年度会议、专题论坛、企业对接等多种形式，搭建中外医药领域沟通与合作的桥梁。此次大会围绕创新药物、细胞基因治疗、AI制药、合成生物学等前沿方向展开深入探讨，成为年度医药行业的重要风向标。

在大会展区，菲鹏数辉带来的 DeepConformer 2.0 模型备受瞩目。该模型是国内首个能够实现“复合蛋白质动态构象预测”的人工智能系统，可显著提升大分子药物设计的效率与成功率。菲鹏数辉创始人兼首席科学家马步勇教授在专题论坛中介绍，该模型已从单链蛋白质构象预测升级至复合蛋白质动态预测，能够更真实地反映蛋白质在生命体内的相互作用。

马步勇教授指出，蛋白质在发挥功能时往往通过特定构象与其它分子结合，这一过程被称为“构象选择”。DeepConformer 2.0 基于扩散模型框架，可直接从蛋白质序列预测其三维动态构象，高效捕捉功能相关的结构变化，从而为靶点发现与药物分子设计提供新思路。他生动地比喻：“蛋白质之间的相互作用如同跳探戈，既独立又高度协同。”

在实际应用中，DeepConformer 2.0 不仅可复现酶分子模拟中的残基波动，还能够预测突变对底物特异性的影响，甚至在抗体-抗原复合物构象预测方面表现出优于现有工具的准确性。基于该技术，菲鹏数辉已与菲鹏制药展开多项靶点合作，成功获得多个高亲和力结合分子，展现出良好的应用前景。

目前，菲鹏数辉已建立起包括 AI-蛋白质工程、AI-RNA 设计优化和 AI-抗体筛选优化在内的三大技术平台，推动动态构象预测技术走向实际药物研发与精准医疗领域。马步勇教授表示，未来公司将继续拓展动态构象设计技术在大分子、小分子及适配体等领域的应用，以人工智能推动生物医药研发进入新阶段。